外泌體small RNA測序服務
項目簡介
外泌體small RNA測序服務
miRNA是一類17 ~ 24 nt的非編碼RNA,能介導基因的轉錄後沉默,與細胞增殖分化、遷移、疾病發生和疾病進展都有關係。2014年,Goldie等人發現miRNA在外泌體中所占的比例高於外泌體來源細胞,表明miRNA特異地富集於外泌體中。自此,外泌體miRNA的作用受到越來越多的關注:循環的囊泡(如外泌體)被認為是與通過細胞接觸或可溶分子轉運的信號傳導一樣重要的第三種細胞間通訊途徑。
表觀生物采用來源於美國Exosome Diagnostics, Inc.公司的獨家技術——QIAGEN exoRNeasy Serum/Plasma Maxi Kit 提取外泌體RNA,能夠在20分鍾內快速純化得到細胞外囊泡,並獲得更為全麵的RNA分子,廣泛兼容來自細胞培養基上清、血清血漿及其他體液的外泌體樣本,為後續RNA功能研究奠定基礎。
在建庫技術方麵,表觀生物對外泌體small RNA測序服務也進行了革新,采用QIAseq NGS panels專有的數字NGS技術,基於QIAseq miRNA Library Kit的建庫策略無需切膠分離小RNA(Gel-free),能夠實現對外泌體miRNA等稀少樣本的無偏向準確定量。結合最新的高通量測序技術和生物信息分析方案(樣本≥10個,即送miRNA調控網絡分析),將為您提供最為全麵的外泌體miRNA測序服務!
項目流程
測序方案
測序平台:Illumina 3000/4000 。 測序數據:SE50 10M reads 。 樣本類型:血清/血漿、培養基上清、尿液、唾液等
人、大小鼠
適用物種
10 VS 10
樣本分組
分析內容
基礎分析
1.原始數據過濾、質控
2.基因組、miRbase22、Rfam比對
3.miRNA分析
4.piRNA分析
5.tsRNA分析
6.small RNA差異表達分析
高級分析
1.small RNA靶基因分析
2.small RNA靶基因G0分析
3.small RNA靶基因KEGG分析
4.small RNA-mRNA調控網絡圖
參考案例
脂肪組織巨噬細胞的外泌體能夠調節胰島素抵抗性
肥胖引起的慢性組織炎症是胰島素抵抗和2型糖尿病的根本原因。加州大學的研究者發現外泌體介導的細胞間通訊導致了糖尿病中的代謝紊亂,外泌體攜帶的miRNA參與了糖尿病產生的關鍵機製。
原文
Ying et al., Adipose Tissue Macrophage-Derived Exosomal miRNAs Can Modulate In Vivo and In Vitro In- sulin Sensitivity, Cell (2017),