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Molecular Cell | 缺氧誘導ZHX2相分離改變染色質環,驅動癌症轉移-廣州表觀生物科技有限公司

Molecular Cell | 缺氧誘導ZHX2相分離改變染色質環,驅動癌症轉移

2025-11-26

缺que氧yang是shi否fou調tiao控kong與yu轉zhuan錄lu相xiang關guan的de相xiang分fen離li仍reng是shi未wei知zhi的de。在zai實shi體ti瘤liu中zhong,缺que氧yang是shi一yi個ge關guan鍵jian特te征zheng,與yu惡e性xing程cheng度du和he不bu良liang預yu後hou相xiang關guan。最zui著zhu名ming的de缺que氧yang反fan應ying涉she及ji轉zhuan錄lu調tiao控kong的de改gai變bian,但dan新xin證zheng據ju表biao明ming缺que氧yang會hui誘you導dao缺que氧yang誘you導dao因yin子zi(HIF)之外的多種適應性信號。

轉錄因子ZHX2zinc fingers and homeoboxes 2)是一個新近被發現的VHL底物,它可以通過HIFyilaihefeiyilaidefangshijihuoaijiyin,qudongzhongliuexingjinzhan。tongshi,shengwudafenzixiangfenlinengjiangdanbaizhihehesuanfengechengwumoxibaoqi,zheyiguochengtongchangyilaiyuneizaiwuxuqu(IDR)。相分離可以在轉錄活躍的區域重塑三維染色質組織,但在癌症中鑒定特異性的相分離仍是巨大挑戰。ZHX2如何在缺氧條件下被調控,以及染色質結構對氧氣敏感性的機製,目前尚不清楚。

 

 

論文索引

 

DOI】10.1016/j.molcel.2025.03.009

發表時間】2025年4月17日

標題】Hypoxia-induced phase separation of ZHX2 alters chromatin looping to drive cancer metastasis

單位/通訊作者】武漢大學 張敬

關鍵詞】ZHX2;相分離;缺氧;IDR;CTCF;染色質環;癌症轉移

 

該研究揭示了一種由缺氧特異性誘導的ZHX2相分離機製。研究發現,轉錄因子ZHX2在缺氧反應下發生相分離,促進其在染色質上的占據,並激活一係列癌基因的轉錄。這些基因富集為轉移相關基因,且不同於HIF的靶點,與乳腺癌的病理進展密切相關。機製上,缺氧通過一個富含脯氨酸的內在無序區誘導ZHX2相分離,這會增強ZHX2在S625和S628位點的磷酸化,進而將CTCF招募到轉錄凝聚體中,改變染色質環,最終驅動轉移基因的轉錄和癌症轉移。這些發現為理解癌基因激活提供了重要見解,並提示了一種基於相分離的癌症治療策略。

 

                                                                                                 

 

 

 

 

 

 

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研究思路與技術路線

   

 

 

 

 

 

 

 

 

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關鍵研究結果

1、ZHX2在缺氧反應下形成核內凝聚體

 

研究通過熒光成像技術,在多種乳腺癌細胞係(MCF7, T47D, MDA-MB-231)中觀察到,ZHX2-EGFP在缺氧(1% O₂)條件下會形成明顯的核內凝聚體,而在常氧(21% O₂)條件下則彌散分布。

 

這種凝聚體的形成是可逆的,在複氧後30秒內斑點即消失。ZHX2的聚集是缺氧特異性的,在其他細胞應激(如pH變化、葡萄糖/穀氨酰胺饑餓、MG132、UV照射等)下均未觀察到斑點形成。

 

而在乳腺癌患者的腫瘤組織和異種移植腫瘤模型中也觀察到了ZHX2核凝聚體

 


 

2、富含脯氨酸的IDR介導ZHX2的缺氧誘導相分離

研究使用1,6-己二醇(1,6-hex)處理細胞,可阻斷缺氧誘導的ZHX2凝聚體形成。

 


體外純化的重組ZHX2-EGFP蛋白在特定濃度下也表現出鹽敏感的球形斑點,證實了ZHX2凝聚體具有相分離特性。通過結構預測和OptoDroplet光遺傳學技術分析,研究發現ZHX2的核定位序列(NLS;317-446 aa)區域內的IDR是驅動其相分離的主要區域;

 

刪除NLS(ΔNLS)則無法在光照或缺氧下形成斑點(D-G)。

 

將該區域的7個脯氨酸全部突變為丙氨酸(PA突變體)後,ZHX2在缺氧條件下完全喪失了形成凝聚體的能力。這表明,該富含脯氨酸的IDR是ZHX2響應缺氧並誘導相分離的關鍵。

 


 

3、ZHX2相分離作為支架招募轉錄激活複合體

免疫熒光染色顯示,缺氧誘導的ZHX2凝聚體與多種轉錄激活標記H3K27ac, H3K4me1, H3K4me3, MED1, BRD4, RNA Pol II-S5P, p300)高度共定位。

 

Co-IP實驗證實,與常氧相比,ZHX2在缺氧時與RNA Pol II-S5P, p300, BRD4, 和 MED1的相互作用顯著增強

 

無法發生相分離的PA突變體,在缺氧時幾乎不與這些共激活因子共定位,也幾乎不發生相互作用。這些結果表明,ZHX2在缺氧時首先獨立發生相分離,並作為“支架”招募這些轉錄共激活因子到凝聚體中。

 


 

4、ZHX2相分離激活一套不同於HIF靶點的轉移基因特征集

 

ChIP-seq分析結果顯示,在缺氧條件下,ZHX2在全基因組的占據位點數量和結合強度均顯著增加,而PA突變體的基因組占據和結合強度與WT型相比則明顯下降,表明ZHX2的相分離是其在缺氧時廣泛結合染色質所必需的。

 

結合RNA-seq的結果綜合分析,研究鑒定出125個“ZHX2 相分離基因”,它們在缺氧時以相分離依賴的方式被ZHX2直接結合並轉錄激活,且其激活獨立於HIF1α/HIF2α(C, D, E)

 

GO富集分析結果顯示,這些基因高度富集在與癌症轉移相關的通路。對乳腺癌患者的scRNA-seq數據分析證實,該轉移特征集主要在惡性細胞中高表達

 


 

5、ZHX2相分離通過招募CTCF重塑染色質環

Co-IP和FRET-FLIM實驗證明,缺氧誘導了ZHX2和CTCF之間的直接相互作用(A, B),而PA突變體則無法與CTCF結合。免疫熒光顯示,CTCF本身在缺氧時也會形成核內斑點,並與ZHX2凝聚體高度共定位(C),表明ZHX2的IDR依賴性相分離將CTCF“拉入”了凝聚體中。

 


Hi-C實驗進一步揭示,缺氧導致了全局性的染色質環重編程,產生了大量缺氧特異性的染色質環(D)。這種染色質環的重塑依賴於ZHX2(E)。3C-qPCR實驗結果證實,ZHX2的PA突變體無法拯救由ZHX2敲低導致的MYC和STC2 E-P環的丟失(G)。

 


 

6、ZHX2相分離促進的S625/S628磷酸化是招募CTCF和驅動轉移的關鍵

蛋白質譜(LC-MS/MS)分析鑒定出ZHX2的兩個相分離增強的磷酸化位點:S625和S628這兩個位點僅在缺氧時,且在具有相分離能力的WT ZHX2上發生磷酸化,表明ZHX2相分離是其S625/S628位點磷酸化的先決條件

 

將這兩個位點突變為丙氨酸(SA突變體)後,ZHX2與CTCF的相互作用被完全阻斷(D)。然而,SA突變體在缺氧時仍能正常發生相分離(形成斑點),但CTCF無法被招募到這些凝聚體中(E)。功能上,SA突變體無法恢複缺失ZHX2後導致的染色質環形成和靶基因(125個相分離基因)的下調(F)。

 


在細胞遷移、侵襲實驗以及小鼠肺轉移模型中,PA突變體(喪失PS)和SA突變體(喪失CTCF招募)均喪失了促進轉移的能力(A-F)。

 

 


 

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研究意義與機製模型

該研究提出了一個精細的調控模型:在缺氧條件下,ZHX2首先通過其富含脯氨酸的IDR發生相分離,形成核內凝聚體。這種相分離狀態作為平台,一方麵招募了MED1、BRD4和RNA Pol II等轉錄共激活因子;另一方麵,它促進了ZHX2自身的S625和S628位點磷酸化。磷酸化的ZHX2進而獲得了與CTCF結合的能力,將CTCF招募到凝聚體中。最終,ZHX2-CTCF軸在凝聚體內重塑了染色質高級結構,形成了新的增強子-啟動子環(E-P looping),高效激活了包括MYC在內的一係列轉移相關癌基因,驅動癌症進展。該機製揭示了染色質環如何動態響應氧氣變化,並為靶向ZHX2-CTCF軸提供了新的癌症治療思路。

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