超級增強子鑒定服務
項目簡介
超級增強子鑒定服務
超級增強子 (Super Enhancer, SE) 為8 ~ 20 kb具有轉錄增強活性的超長順式作用元件,可富集高密度的關鍵轉錄因子(master transcription factors)、輔因子(cofactor)和增強子表觀修飾標記(histone modification marks),並(bing)激(ji)活(huo)細(xi)胞(bao)中(zhong)身(shen)份(fen)決(jue)定(ding)基(ji)因(yin)的(de)表(biao)達(da),發(fa)揮(hui)調(tiao)控(kong)細(xi)胞(bao)命(ming)運(yun)的(de)關(guan)鍵(jian)作(zuo)用(yong),還(hai)能(neng)促(cu)進(jin)關(guan)鍵(jian)致(zhi)癌(ai)基(ji)因(yin)表(biao)達(da),富(fu)集(ji)疾(ji)病(bing)相(xiang)關(guan)變(bian)異(yi),具(ju)有(you)重(zhong)大(da)研(yan)究(jiu)價(jia)值(zhi),已(yi)經(jing)成(cheng)為(wei)生(sheng)物(wu)醫(yi)學(xue)領(ling)域(yu)的(de)研(yan)究(jiu)熱(re)點(dian)。
醫學研究意義:1. 發現致病驅動基因。2. 分析疾病關聯變異位點易感性。3. 開發基於SEs複雜性疾病的精準診斷和藥物開發
鑒定流程
測序流程
送樣要求
使用抗體:anti-H3K27ac/ anti-BRD4/ anti-P300
細胞/組織
樣本類型
10*10^7
細胞數量
甲醛交聯
樣本處理
分析結果示例1
普通增強子與超級增強子差異(長度及數目)分析
分析結果示例2
普通增強子與超級增強子鑒定分析
分析結果示例3
超級增強子鑒定及數量分析圖繪製
分析結果示例4
超級增強子結合轉錄因子預測
分析結果示例5
普通增強子與超級增強子信號富集圖繪製
分析結果示例6
超級增強子的注釋及調控靶基因預測
分析結果示例7
超級增強子調控靶基因KEGG、GO分析
超級增強子整體課題研究策略