表觀修飾質譜服務，N多選擇！核酸、蛋白質、組蛋白、糖RNA等修飾質譜
核酸修飾質譜主要通過多重PCR、高通量芯片以及高分辨率質譜來實現核酸檢測，是繼PCR、高通量測序技術之後新型的分子診斷技術，能夠將兩者技術優勢相結合，具有通量大、靈敏度高、檢測精度高、檢測速度快、成本低等優點[1]。表觀生物利用Bruker timsTOF Pro2捕集離子淌度飛行時間質譜儀、SCIEX zenoTOF 7600、SCIEX 6500+質譜平台係統，結合對核酸修飾分析領域的領先技術優勢，推出針對包括多種RNA、DNA特別是糖 RNA 的核酸修飾質譜分析服務，精確檢測多種核酸修飾類型在樣本中的修飾豐度。
一、核酸修飾質譜
1、多種 RNA 修飾質譜分析
RNA上的化學修飾對於RNA的結構和功能起到了重要的調控作用，闡明RNA修飾的生物學意義需要能特異性檢測、量化修飾核苷進行高靈敏度分析的工具。
表觀生物RNA修飾質譜分析，對mRNA、tRNA 和 total RNA樣本分別可精確檢測18 種、37 種、26 種RNA修飾類型。
mRNA 可檢測修飾列表
樣品需求量：0.5~1 µg
可分析樣品：mRNA、tRNA 和 total RNA
樣品處理時間：質譜前處理時間約1天，具體根據RNA類型而定
質譜分析時間：每個樣品15 min
服務周期：一周到兩周（具體根據 RNA 類型以及樣品數量而定）
分析方法：靶向分析或非靶向分析
預期結果：mRNA經ploy(A)富集後並使用rRNA去除技術後可達18種高保真度mRNA修飾；tRNA根據富集方法可檢測37種修飾；total RNA可檢測26種修飾（大多數來源於 rRNA 及 tRNA 修飾），具體看以下列表：
tRNA 可檢測修飾列表
total RNA 可檢測修飾列表
2、糖 RNA 糖組質譜分析
2021年，Flynn等人首次報告稱RNA可以以糖RNA（即糖基化 RNA，英文為 GlycoRNA）的形式在細胞外存在[2], 揭示了細胞表麵生物學中以前未被認識的複雜層麵。2024年8月，Flynn團隊發現RNA與N- 聚糖化學連接的機製[3]，證明糖綴合物不僅有糖蛋白和糖脂，還有第三類：糖RNA。2024年Flynn團隊也已在預印本文章中報道糖RNA存在O- 聚糖的證據[4]。糖RNA可能是免疫係統識別和響應細胞的關鍵組成部分；細胞表麵存在糖RNA也可能對細胞間通訊和信號傳導產生更廣泛的影響。
表觀生物推出糖RNA糖組質譜分析服務，可檢測並定量高甘露糖、岩藻糖化、唾液酸化等60種以上不同的N-聚糖以及約10種core2類型O-聚糖，探索糖RNA生物學的更多秘密。
樣品需求量：2~10 µg
可分析樣品：小RNA組分
樣品處理時間：N- 聚糖處理時間為2天，O-聚糖處理時間為3天
質譜分析時間：每個樣品分析需70 min，大隊列樣品可選擇高通量的基質輔助激光解吸電離 (MALDI) 質譜分析，每個樣品分析僅需3 min
服務周期：預計2周完成整個流程（若樣品數量≥ 100，周期需酌情延長）
分析方法：非靶向N-聚糖或 / 及O-聚糖分析
預期結果：可檢測並定量高甘露糖、岩藻糖化、唾液酸化等60種以上不同的N 聚糖以及約10種core2類型O-聚糖
3、糖 RNA 修飾質譜分析
糖基化 (Glycosylation) 是生物分子最普遍、最重要的修飾之一，這些修飾在細胞識別、信號傳導、蛋白質折疊和穩定性以及免疫反應等生物過程中發揮關鍵作用。2024年8月，Flynn團隊發現修飾的RNA堿基 acp3U是糖RNA中N-聚糖的結合位點[3]。此後，越來越多研究開始關注 RNA糖基化的標記、監測及生物功能。然而，由於糖RNA分子含量極低（預計在總體RNA分子中的含量低於0.001%），依賴傳統手段獲取這一關鍵信息極其困難。
表觀生物推出基於最新rPAL標記技術的糖RNA修飾質譜分析服務，通過生物素-親和素係統和強洗滌條件對糖RNA進行高效富集，並進行 RNA修飾質譜分析，以極高的靈敏度和特異性識別糖RNA分子中的糖基化位點，突破了傳統RNA分析的限製，為研究RNA修飾和糖基化的關係、RNA與糖鏈之間的複雜相互作用提供了強有力的工具。
樣品需求量：具體請詳詢
可分析樣品：富集後的糖RNA組分
樣品處理時間：質譜前處理時間約1天
質譜分析時間：每個樣品20 min
服務周期：預計3~4天完成整個流程（若樣品數量≥ 100，周期需酌情延長）
分析方法：非靶向分析
預期結果：acp3U、galQ、manQ 等糖RNA鏈接修飾及其他可能存在的共存修飾
4、DNA 修飾質譜分析
DNA分子上的5mC和5hmC是哺乳動物基因組中兩種最重要的表觀遺傳修飾，在調控基因表達及細胞功能方麵扮演著不可或缺的角色，它們在DNA分子上的分布和動態變化對於理解基因表達和細胞命運的決定具有重要意義。然而，傳統的DNA甲基組測序方法無法區分這兩種修飾，限製了對兩者在基因組中分布和動態關聯的研究。
表觀生物DNA修飾質譜分析可檢測5mC和5hmc兩種DNA甲基化修飾，助力研究者進一步揭示它們在疾病發生發展過程中的作用。
樣品需求量：0.5~1 µg
可分析樣品：DNA
樣品處理時間：質譜前處理時間約1天
質譜分析時間：每個樣品15 min
服務周期：1周（若樣品數量≥ 100，周期需酌情延長）
分析方法：非靶向N-聚糖或 / 及O-聚糖分析（可選 LC 或 MALDI 分析）
預期結果：通常檢測5mC和5hmC，潛在檢測5fC
二、蛋白質修飾質譜
人(ren)類(lei)蛋(dan)白(bai)質(zhi)組(zu)包(bao)含(han)的(de)許(xu)多(duo)的(de)功(gong)能(neng)性(xing)多(duo)肽(tai)，跟(gen)翻(fan)譯(yi)的(de)同(tong)時(shi)和(he)翻(fan)譯(yi)後(hou)的(de)蛋(dan)白(bai)修(xiu)飾(shi)密(mi)切(qie)相(xiang)關(guan)，所(suo)以(yi)識(shi)別(bie)翻(fan)譯(yi)後(hou)修(xiu)飾(shi)的(de)蛋(dan)白(bai)質(zhi)及(ji)其(qi)修(xiu)飾(shi)位(wei)點(dian)，是(shi)蛋(dan)白(bai)質(zhi)組(zu)學(xue)研(yan)究(jiu)的(de)重(zhong)要(yao)領(ling)域(yu)之(zhi)一(yi)。蛋(dan)白(bai)質(zhi)修(xiu)飾(shi)的(de)常(chang)見(jian)類(lei)型(xing)包(bao)括(kuo)糖(tang)基(ji)化(hua)、磷酸化、甲基化、乙酰化和泛素化等。質譜是對血液、細胞、組織等生物樣本進行以上多種蛋白質翻譯後修飾定量分析的重要手段。
表觀生物蛋白質修飾質譜分析服務，基於timsTOF Pro2捕集離子淌度飛行時間質譜儀和SCIEX zenoTOF 7600飛行時間質譜儀等業內一流分析測試設備，結合在蛋白質組分析領域的領先技術優勢，重點發展微量、痕量、低豐度蛋白樣本的深度鑒定技術與麵向臨床的蛋白質糖基化深度精準分析技術，可實現低豐度蛋白質和蛋白質翻譯後修飾（糖基化、磷酸化等）的高覆蓋、高通量、高靈敏度定性和定量分析。
樣本需求量與可分析樣本：
1. 細胞，≥ 1×107 個細胞/樣本
2. 蛋白質，≥ 1mg/樣本
3. 血清、尿液、腦脊液等體液樣本，具體請詳詢
服務周期：預計2周完成整個流程
分析方法：4D糖蛋白組或EAD糖蛋白組（更高置信度的位點鑒定）
預期結果：原位解析糖型、糖基化位點、糖基化肽段和相應蛋白
可檢測修飾類型與應用
三、組蛋白修飾質譜
組蛋白修飾（Histone Post-Translational Modification）是最為重要且多樣的表觀調控方式，因此組蛋白及相關修飾一直受到廣大研究者關注。組蛋白修飾傳統方法ChIP-seq一次隻能對一個位點的一種修飾進行檢測，而表觀生物組蛋白修飾質譜分析可檢測並定量150種以上不同的組蛋白修飾肽段，為研究組蛋白修飾在生理和病理發生發展過程中的作用提供全新的研究方案。
樣品需求量：1~10 µg
可分析樣品：細胞或組織組蛋白提取物
樣品處理時間：組蛋白提取需2 天，質譜前處理時間1 天
質譜分析時間：每個樣品20 min
服務周期：預計1周完成整個流程（超過100個樣品，周期需延長）
分析方法：非數據依賴型組蛋白定量分析
預期結果：可檢測並定量 150 種以上不同的組蛋白修飾肽段
可檢測組蛋白修飾肽段
可檢測組蛋白修飾位點